Разница в том, что теория Птолемея предлагается как факт истории науки, а не как равноправная научная теория или "альтернативная точка зрения".
Против упоминания креационизма в контексте истории религии никто вроде бы не возражает. А к биологии он имеет куда меньшее отношение, чем теория Птолемея к астрономии.